El primer documento que describe un sistema organizado para el diagnóstico y tratamiento (reconocido por la acupuntura) es “the yellow Emperor’s clasic of internal medicine” del año 100 A.C. La información es presentada en forma de preguntas, realizadas por el Emperador y respondidas por su primer ministro. El texto es probablemente una compilación de tradiciones, y presentada en términos de la filosofía Taotista. El concepto de canales (meridianos y colarerales) en que la energía vital Qi fluye son establecidos en esta época. Aunque la localización anatómica precisa de los puntos de acupuntura se desarrollara después.
La acupuntura continuo su desarrollo en las siguientes centurias y gradualmente se convirtieron en un una terapia estándar en China, de la misma manera que lo fue el uso de hierbas (Fitoterapia China), masaje, dieta y la moxibustion.
Estatuas de bronce del siglo XV muestran los puntos de acupuntura que se emplean hoy en día.
Durante la dinastía Ming (1364-1644) fue publicado el gran compendio de acupuntura y moxibustion.
En él hay una clara descripción de los 265 puntos que representan las entradas a los canales, y que a través de agujas insertadas se puede modificar el flujo de la energía Qi. Hay que señalar que el conocimiento de salud-enfermedad en China se desarrolló puramente por la observación de seres vivos porque la disección humana estaba prohibida, y la anatomía era desconocida.
El interés por la acupuntura disminuyo entre los chinos en el siglo XVII por lo que en adelante fue sujeto de irracional y superstición. De hecho, fue excluido del Instituto Médico Imperial por decreto del emperador en 1822. Este declive gradual llevo a la acupuntura (y otras formas de medicina tradicional) a estar fuera de la ley, en a que en 1929.
Después de la instalación del gobierno comunista en 1949, las formas tradicionales de medicina, incluyendo la acupuntura, fueron restauradas posiblemente por motivos nacionalistas pero también como un medio de proveer salud a niveles masivos de la población. Así, la acupuntura regreso a los institutos en 1950.